Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LcorlQ3U285 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LcorlQ3U285 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms