Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc136Q3TVA9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc136Q3TVA9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms