Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q3TTJ4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms