Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp39Q3TIX9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms