Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Prr27Q3SYJ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Prr27Q3SYJ2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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