Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpusd2Q149F1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Rpusd2Q149F1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpusd2Q149F1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms