Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc162pQ0VG85 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms