Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms