Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cnn1Q08091 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cnn1Q08091 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms