Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrx2Q06348 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrx2Q06348 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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