Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CkbQ04447 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CkbQ04447 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CkbQ04447 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CkbQ04447 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CkbQ04447 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CkbQ04447 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms