Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tff2Q03404 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tff2Q03404 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms