Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Thbs2Q03350 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs2Q03350 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms