Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pax5Q02650 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax5Q02650 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms