Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GscQ02591 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GscQ02591 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GscQ02591 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GscQ02591 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GscQ02591 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms