Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcqQ02111 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcqQ02111 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms