Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gbp1Q01514 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms