Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SelpQ01102 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelpQ01102 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms