Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms