Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VldlrP98156 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms