Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1bP97952 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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