Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bop1P97452 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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