Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ccl21cP86793 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccl21cP86793 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccl21cP86793 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccl21cP86793 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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