Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irx2P81066 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Irx2P81066 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Irx2P81066 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms