Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc8a1P70414 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms