Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tgif1P70284 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms