Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stra8P70278 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stra8P70278 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms