Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tbpl1P62340 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbpl1P62340 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms