Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SnrpfP62307 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpfP62307 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms