Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rps11P62281 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rps11P62281 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms