Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ufm1P61961 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms