Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sem1P60897 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sem1P60897 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sem1P60897 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sem1P60897 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sem1P60897 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sem1P60897 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sem1P60897 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sem1P60897 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sem1P60897 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sem1P60897 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sem1P60897 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sem1P60897 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms