Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snap25P60879 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap25P60879 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms