Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3bP59470 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms