Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gsc2P56916 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gsc2P56916 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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