Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rad23aP54726 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms