Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2e3P52483 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms