Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pold1P52431 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pold1P52431 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pold1P52431 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pold1P52431 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pold1P52431 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms