Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FmodP50608 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FmodP50608 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FmodP50608 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FmodP50608 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FmodP50608 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FmodP50608 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FmodP50608 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FmodP50608 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FmodP50608 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms