Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psen1P49769 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psen1P49769 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psen1P49769 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms