Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LmnaP48678 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms