Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prox1P48437 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms