Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VdrP48281 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VdrP48281 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VdrP48281 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VdrP48281 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VdrP48281 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VdrP48281 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VdrP48281 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VdrP48281 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms