Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tac1P41539 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tac1P41539 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tac1P41539 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms