Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf9P41274 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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