Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc10P31257 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc10P31257 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms