Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms