Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mmp3P28862 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp3P28862 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms