Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col2a1P28481 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms