Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Defa3P28310 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms